Наиболее распространённым способом обезвоживания материала является проводка через этиловый или изопропиловый спирт. Изопропиловый спирт обладает лучшими обезвоживающими свойствами по сравнению с этанолом и при этом меньше подвергает ткани деформации, благодаря этим свойством всё большее количество лабораторий предпочитает использовать его для проводки.
После фиксации ткань сразу помещают в изопропиловый спирт максимальной концентрации. Материал последовательно перемещается из одной ёмкости в другую. Как при проводке в этаноле, так и в изопропаноле используется как минимум 4-5 емкостей, и при ручной проводке, как правило, ограничиваются этим количеством. Если же используется автоматическая проводка, то количество емкостей может увеличиться до 10 и более.